2、法规和规划财务科（行政审批服务科）。推进医疗保障标准化和信息化建设，组织拟定全市医疗保障工作规划，承担医疗保障系统统计管理和项目管理工作；承担机关规范性文件合法性审查和清理工作，承担行政复议、行政应诉有关工作。负责组织、协调行政审批相关工作，负责行政审批相关接待、咨询、受理、办理结果公示等工作；负责组织行政审批事项执行情况的后续监管。
3、待遇保障科。贯彻落实城镇职工医疗保障、生育保险、医疗救助、离休干部医疗保障、移交政府安置的军队离退休干部医疗保障、城乡居民医疗保障筹资和待遇政策；统筹推进城镇职工和城乡居民多层次医疗保障体系建设；统筹城乡居民基本医疗保险、大病保险、困难群众大病补充医疗保险、医疗救助工作；建立健全医疗保险关系转移接续制度；推进长期护理保险制度改革。
4、医药服务管理科（异地就医管理科）。组织实施医保目录和支付标准，建立动态调整机制，落实医保目录准入谈判规则；拟订定点医药机构医保协议和支付管理、异地就医管理办法和结算政策性措施。组织推进医保支付方式改革；组织开展药品、医用耗材、医疗技术的经济性评价。
5、基金监管科（医药价格监管科）。组织实施医疗保障基金监督管理办法，建立健全医疗保障基金安全防控机制，建立健全医疗保障信用评价体系和信息披露制度，监督管理纳入医保支付范围的医疗服务行为和医疗费用，规范医保经办业务；负责医疗保障系统举报投诉案件的调查工作，依法查处医疗保障领域违法违规行为。贯彻落实药品、医用耗材价格和医疗服务项目、医疗服务设施收费等政策，建立价格信息监测和发布制度；贯彻落实药品、医用耗材的招标采购、配送及结算管理政策。
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